微生物实验室设备主要有：发酵罐、高压灭菌锅、超净工作台、电热恒温培养箱、恒温恒湿培养箱、电热鼓风干燥箱、移液器、电子显微镜、冰箱、全温振荡器、远红外快速干燥箱等实验室设备。实验室可以进行微生物的培养，微生物代谢产物的生产与分离，纯水机及饮用水微生物指标检测，微生物的筛选等实验。